Ο Παναθηναϊκός έχει μπροστά του ένα μεσημέρι που θα καθορίσει σε μεγάλο βαθμό την ευρωπαϊκή του σεζόν. Η κλήρωση της Παρασκευής (28/08, 14:00) θα βάλει τους «πράσινους» στη League Phase του Conference League, απέναντι σε έξι διαφορετικές ομάδες που θα προκύψουν από τη νέα, ενιαία φόρμουλα της διοργάνωσης. Το «εισιτήριο» ήρθε μετά την ανατροπή επί της Λανς (2-0 στο Ολυμπιακό Στάδιο), που έσβησε το 2-1 του πρώτου αγώνα και έστειλε την ομάδα του Ντιέγκο Αλόνσο στο επόμενο στάδιο.
Στη νέα μορφή, οι 36 ομάδες του Conference δεν χωρίζονται πλέον σε ομίλους των τεσσάρων. Όλες μπαίνουν σε μία ενιαία βαθμολογία και η καθεμία δίνει έξι αγώνες, τρεις εντός και τρεις εκτός έδρας, απέναντι σε έξι διαφορετικούς αντιπάλους. Εδώ υπάρχει μια διαφορά με τα άλλα δύο ευρωπαϊκά κύπελλα: στο Champions League και στο Europa League οι ομάδες παίζουν οκτώ ματς στη League Phase, ενώ στο Conference League οι αγωνιστικές είναι έξι. Το πρώτο παιχνίδι του Παναθηναϊκού έχει οριστεί για τις 15 Οκτωβρίου και το τελευταίο για τις 17 Δεκεμβρίου.
Ο τρόπος που θα προκύψουν οι αντίπαλοι είναι συγκεκριμένος. Κάθε ομάδα θα κληρωθεί με έναν αντίπαλο από κάθε γκρουπ δυναμικότητας, με τον Παναθηναϊκό να βρίσκεται στο δεύτερο γκρουπ έχοντας συντελεστή 29.250. Αυτό του εξασφαλίζει ένα πιο βατό ταμπλό, αφού οι πιο δύσκολες ομάδες βρίσκονται στο πρώτο γκρουπ -εκεί όπου δεσπόζουν τα μεγάλα ονόματα της διοργάνωσης- και οι πιο αδύναμες στα τελευταία. Παράλληλα, υπάρχει ένας αυστηρός κανόνας που αφορά άμεσα τον Παναθηναϊκό: απαγορεύεται να αντιμετωπίσει ομάδα από την ίδια χώρα στη League Phase, κάτι που σημαίνει ότι δεν πρόκειται να βρεθεί στο δρόμο του ο ΠΑΟΚ ή ο ΟΦΗ, σε περίπτωση που προκριθούν.
Στη διαδικασία των νοκ άουτ, οι οκτώ πρώτοι της ενιαίας βαθμολογίας περνούν απευθείας στη φάση των 16, ενώ οι ομάδες από την 9η έως την 24η θέση θα παίξουν διπλούς αγώνες για να συμπληρώσουν το ταμπλό. Όσοι τερματίσουν από την 25η θέση και κάτω αποκλείονται. Η διαφορά σε σχέση με τα προηγούμενα χρόνια είναι μεγάλη: δεν υπάρχουν πια τρεις αντίπαλοι που συναντάς δύο φορές, εντός και εκτός έδρας, αλλά έξι διαφορετικές ομάδες με μία συνάντηση η καθεμία.
Από εκεί και πέρα, το ενδιαφέρον στρέφεται στις ομάδες που περιμένουν στην κλήρωση. Στο πρώτο γκρουπ βρίσκονται μερικά βαριά ονόματα -ανάμεσά τους η Τσέλσι, η Ρεάλ Μπέτις και η Κοπεγχάγη- ενώ στο ίδιο γκρουπ με τον Παναθηναϊκό είναι ο ΑΠΟΕΛ και η Χάιντενχαϊμ. Στα χαμηλότερα γκρουπ υπάρχουν και κυπριακές και βαλκανικές ομάδες, που ενισχύουν το ενδιαφέρον της κλήρωσης. Το πρώτο δείγμα γραφής για την πορεία του Παναθηναϊκού στη League Phase θα φανεί στις αρχές του φθινοπώρου, με τον τελικό να έχει προγραμματιστεί για τις 2 Ιουνίου 2027 στην Κωνσταντινούπολη.