«Θα περάσω τη ζωή μου πίσω από τα κάγκελα και θα πεθάνω εδώ», αποκάλυψε ο Ναβάλνι τον Μάρτιο του 2022, συνδυάζοντας τον πόνο της φυλάκισης με την ελπίδα για μια καλύτερη Ρωσία. Αφού επέστρεψε στη Ρωσία τον Ιανουάριο του 2021, μόλις λίγους μήνες μετά τη δηλητηρίασή του, συνελήφθη και καταδικάστηκε σε 19 χρόνια φυλάκιση σε σωφρονιστική αποικία, όπου και πέθανε σε ηλικία 47 ετών. «Δεν πρέπει να φοβόμαστε το θάνατο, αλλά να επιτρέπουμε τη χώρα μας να παραδοθεί σε επιτήδειους πλανόδιους», προειδοποιούσε στις 17 Ιανουαρίου 2022.

Κατά τη διάρκεια της μοναχικής του φυλάκισης, ο Ναβάλνι διηγήθηκε στιγμές της καθημερινότητάς του με μια δόση βιτριολικού χιούμορ. «Η μέρα ξεκινάει στις 6 το πρωί και οι επτά ώρες της εργασίας περνούν μπροστά από μια ραπτομηχανή», ανέφερε με τόνο σαρκασμού. Η ιστορία του, γεμάτη θυσίες και αγώνα για δικαιοσύνη, μαρτυρεί την αποφασιστικότητά του να παραμείνει πιστός στα ιδανικά του, ακόμα και εν μέσω της φυλακής.

Η είδηση του θανάτου του προκάλεσε διεθνή κατακραυγή, με πολλές δυτικές χώρες να κατηγορούν τον Πούτιν για την κατάσταση. Ο Ντέιβιντ Ρέμνικ, αρχισυντάκτης του The New Yorker, τόνισε πως είναι αδύνατο να διαβάσει κανείς το ημερολόγιο του Ναβάλνι χωρίς να νιώσει θυμό για τη τραγική του μοίρα. Στο τελευταίο του απόσπασμα, ο Ναβάλνι μοιράστηκε τις σκέψεις του για την επιστροφή του στη Ρωσία: «Σκοπός μου είναι να μην προδώσω τη χώρα μου, αλλά να την υπερασπιστώ, ακόμα κι αν αυτό σημαίνει ότι πρέπει να θυσιαστώ».