Η απώλεια του Γιάννη Ιωαννίδη προκάλεσε βαθιά θλίψη στην ελληνική μπασκετική κοινότητα, με την Basket League να αποτίει φόρο τιμής στη μνήμη του αξεπέραστου προπονητή για την αγωνιστική περίοδο 2023-24.
Στον αγώνα της ΑΕΚ με το Λαύριο για την πρώτη αγωνιστική του πρωταθλήματος, τηρήθηκε ένα λεπτό σιγής στο κλειστό γυμναστήριο των Άνω Λιοσίων, για να τιμηθεί η μνήμη του αείμνηστου. Αξιοσημείωτο είναι ότι δεν ακούστηκε απολύτως τίποτα, με όλους τους παρευρισκόμενους να τηρούν ένα συγκινητικό θρησκευτικό και ελπιδοφόρο ησυχία.
Ο Γιάννης Ιωαννίδης καθήλωνε στον πάγκο της ΑΕΚ από το 1996 έως το 1998, οδηγώντας την ομάδα μέχρι τον τελικό της Α1 και του Κυπέλλου Πρωταθλητριών.