Ο Παναθηναϊκός αντιμετωπίζει σοβαρές συνέπειες από την UEFA, η οποία τηρεί αυστηρή στάση σχετικά με τα πειθαρχικά ζητήματα που αφορούν τη λειτουργία των αγώνων. Η κατάσταση αυτή οφείλεται κυρίως στις καθυστερήσεις στην έναρξη των παιχνιδιών, που ευθύνονται σε μεγάλο βαθμό για την επιβολή ποινών.
Ο Ντιέγκο Αλόνσο, ο Ουρουγουανός προπονητής των «πράσινων», τιμωρήθηκε με μία αγωνιστική ποινής με μονοετή αναστολή εξαιτίας τριών καθυστερημένων έναρξης αγώνων (late kick-offs). Σύμφωνα με τους κανονισμούς της UEFA, εάν η ομάδα καθυστερήσει να παρουσιαστεί για τη σέντρα, η ευθύνη πέφτει στον προπονητή.
Οι καθυστερήσεις αυτές του Παναθηναϊκού αφορούν τον επαναληπτικό αγώνα με τη Μπότεφ, το δεύτερο ματς με τον Άγιαξ και τη ρεβάνς με τη Λανς στο ΟΑΚΑ. Παράλληλα, η UEFA επέβαλε συνολικό πρόστιμο ύψους 129.000 ευρώ για τις δύο αναμετρήσεις με τον Άγιαξ, λόγω της χρήσης λέιζερ, της συμπεριφοράς της ομάδας και των καρτών οδήγησε σε πειθαρχικές ενέργειες. Επιπλέον, το πρόστιμο περιλαμβάνει και το δεύτερο παιχνίδι με τη Λανς για αντίστοιχες παραβάσεις, όπως η χρήση λέιζερ, η μπλοκαρισμένη είσοδος στις εξέδρες, βεγγαλικά και καθυστερημένη έναρξη του ματς.