Ο Απόλλων Σμύρνης θα αγωνιστεί στη Γ’ Εθνική από την επόμενη σεζόν. Μετά τη μη συμμετοχή της ομάδας στη Super League 2, η διοίκηση κατέθεσε τα απαραίτητα έγγραφα για τη συμμετοχή της στο πρωτάθλημα της Γ’ Εθνικής και στον 4ο όμιλο.
Μετά την αποχώρηση του Παναγιώτη Μονεμβασιώτη, οι μετοχές της ομάδας μεταβιβάστηκαν στον Ερασιτέχνη. Η διοίκηση του ΓΣ Απόλλωνα αποφάσισε να συνεχίσει στα ερασιτεχνικά πρωταθλήματα και να ξεκινήσει μια νέα εποχή.
Ο Απόλλων Σμύρνης έχει βρεθεί σε παρόμοια θέση στο παρελθόν, καθώς αγωνίστηκε στη Δ’ Κατηγορία του ελληνικού ποδοσφαίρου την περίοδο 2008-2010.