Ο Παναθηναϊκός θα αντιμετωπίσει τη Μαρσέιγ στην τρίτη προκριματική φάση του Champions League, υπό τον όρο ότι θα εξαλείψει τη Ντνίπρο στον δεύτερο γύρο. Η πρώτη αναμέτρηση θα διεξαχθεί στην Ελλάδα στις 8 ή 9 Αυγούστου, ενώ η ρεβάνς θα γίνει στη Γαλλία στις 15 Αυγούστου. Οι υπόλοιποι αγώνες της φάσης αυτής περιλαμβάνουν τα ζευγάρια Μπράγκα-Μπάτσκα Τόπολα, Ρέιντζερς-Σερβέτ-Γκενκ, και Αϊντχόφεν-Στουρμ Γκρατς.